Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Becn2P0DM65 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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