Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC18P0CG32 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC18P0CG32 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC18P0CG32 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms