Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkbh1P0CB42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Alkbh1P0CB42 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh1P0CB42 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms