Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00271P0C7V0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms