Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO3P0C6S8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO3P0C6S8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO3P0C6S8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms