Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP3P08254 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP3P08254 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP3P08254 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP3P08254 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP3P08254 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP3P08254 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP3P08254 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP3P08254 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP3P08254 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP3P08254 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP3P08254 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP3P08254 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP3P08254 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP3P08254 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP3P08254 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP3P08254 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP3P08254 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP3P08254 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP3P08254 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP3P08254 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP3P08254 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP3P08254 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP3P08254 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP3P08254 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP3P08254 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP3P08254 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP3P08254 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP3P08254 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP3P08254 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP3P08254 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP3P08254 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP3P08254 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP3P08254 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP3P08254 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP3P08254 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP3P08254 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP3P08254 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms