Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC3A2P08195 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC3A2P08195 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC3A2P08195 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC3A2P08195 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC3A2P08195 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms