Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna6P07350 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna6P07350 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna6P07350 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms