Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me1P06801 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me1P06801 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me1P06801 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Me1P06801 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Me1P06801 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me1P06801 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me1P06801 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me1P06801 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me1P06801 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me1P06801 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me1P06801 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me1P06801 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me1P06801 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me1P06801 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Me1P06801 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me1P06801 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me1P06801 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me1P06801 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me1P06801 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me1P06801 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me1P06801 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me1P06801 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me1P06801 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me1P06801 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me1P06801 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me1P06801 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me1P06801 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me1P06801 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me1P06801 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me1P06801 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me1P06801 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me1P06801 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me1P06801 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me1P06801 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me1P06801 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me1P06801 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms