Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCBP05771 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCBP05771 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms