Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P04213 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P04213 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P04213 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P04213 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P04213 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P04213 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P04213 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P04213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P04213 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P04213 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P04213 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P04213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P04213 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P04213 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P04213 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P04213 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P04213 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P04213 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P04213 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P04213 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P04213 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P04213 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P04213 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P04213 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P04213 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P04213 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P04213 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P04213 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P04213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P04213 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P04213 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P04213 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P04213 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P04213 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P04213 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P04213 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P04213 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P04213 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P04213 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P04213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P04213 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P04213 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P04213 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P04213 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms