Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01738 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01738 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01738 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01738 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01738 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01738 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01738 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01738 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01738 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01738 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01738 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01738 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01738 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01738 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01738 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2163.8 ms