Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01655 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01655 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01655 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01655 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01655 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01655 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01655 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01655 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01655 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01655 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01655 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01655 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01655 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01655 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01655 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01655 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01655 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01655 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01655 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01655 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01655 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms