Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01645 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01645 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01645 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01645 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01645 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01645 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01645 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01645 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01645 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01645 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01645 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01645 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01645 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01645 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01645 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01645 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01645 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01645 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01645 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01645 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01645 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01645 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01645 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01645 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms