Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFNB1P01574 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms