Protein–RNA interactions for Protein: O95751

LDOC1, Protein LDOC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDOC1O95751 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDOC1O95751 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDOC1O95751 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDOC1O95751 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms