Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX6O95503 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX6O95503 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX6O95503 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX6O95503 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX6O95503 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX6O95503 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX6O95503 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX6O95503 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX6O95503 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX6O95503 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms