Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB6O95452 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB6O95452 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB6O95452 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB6O95452 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB6O95452 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB6O95452 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB6O95452 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB6O95452 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB6O95452 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB6O95452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB6O95452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.6 ms