Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5LO95447 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms