Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcxO88809 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcxO88809 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcxO88809 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DcxO88809 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DcxO88809 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcxO88809 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DcxO88809 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DcxO88809 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DcxO88809 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DcxO88809 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DcxO88809 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcxO88809 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DcxO88809 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DcxO88809 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcxO88809 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcxO88809 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcxO88809 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcxO88809 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcxO88809 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcxO88809 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcxO88809 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcxO88809 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcxO88809 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DcxO88809 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DcxO88809 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcxO88809 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcxO88809 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcxO88809 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcxO88809 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcxO88809 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcxO88809 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcxO88809 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcxO88809 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcxO88809 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcxO88809 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcxO88809 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcxO88809 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms