Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sorl1O88307 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms