Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL2O75678 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms