Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MITFO75030 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MITFO75030 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MITFO75030 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MITFO75030 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MITFO75030 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MITFO75030 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MITFO75030 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MITFO75030 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MITFO75030 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MITFO75030 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MITFO75030 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MITFO75030 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MITFO75030 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MITFO75030 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MITFO75030 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MITFO75030 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MITFO75030 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MITFO75030 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MITFO75030 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MITFO75030 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MITFO75030 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms