Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KERAO60938 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KERAO60938 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KERAO60938 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KERAO60938 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KERAO60938 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KERAO60938 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KERAO60938 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KERAO60938 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KERAO60938 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KERAO60938 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KERAO60938 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KERAO60938 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms