Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OPHN1O60890 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPHN1O60890 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPHN1O60890 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms