Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSCO60682 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSCO60682 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSCO60682 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSCO60682 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MSCO60682 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MSCO60682 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSCO60682 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSCO60682 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSCO60682 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSCO60682 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSCO60682 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSCO60682 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSCO60682 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSCO60682 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSCO60682 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MSCO60682 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSCO60682 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSCO60682 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSCO60682 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSCO60682 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSCO60682 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSCO60682 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSCO60682 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSCO60682 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSCO60682 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSCO60682 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSCO60682 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSCO60682 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSCO60682 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSCO60682 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSCO60682 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSCO60682 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MSCO60682 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSCO60682 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSCO60682 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSCO60682 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSCO60682 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSCO60682 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSCO60682 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSCO60682 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms