Protein–RNA interactions for Protein: O60313

OPA1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA1O60313 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPA1O60313 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPA1O60313 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OPA1O60313 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPA1O60313 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPA1O60313 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPA1O60313 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPA1O60313 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPA1O60313 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPA1O60313 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPA1O60313 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPA1O60313 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPA1O60313 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms