Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Supt5hO55201 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Supt5hO55201 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt5hO55201 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Supt5hO55201 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms