Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx3O55144 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx3O55144 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx3O55144 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms