Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copb2O55029 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb2O55029 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb2O55029 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb2O55029 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1616.9 ms