Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2AO43736 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2AO43736 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms