Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASA4O43374 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASA4O43374 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASA4O43374 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASA4O43374 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASA4O43374 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASA4O43374 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASA4O43374 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASA4O43374 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASA4O43374 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASA4O43374 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASA4O43374 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASA4O43374 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASA4O43374 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASA4O43374 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASA4O43374 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASA4O43374 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASA4O43374 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASA4O43374 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASA4O43374 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASA4O43374 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASA4O43374 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASA4O43374 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASA4O43374 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASA4O43374 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASA4O43374 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASA4O43374 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASA4O43374 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASA4O43374 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASA4O43374 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASA4O43374 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms