Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCP110O43303 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCP110O43303 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCP110O43303 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCP110O43303 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCP110O43303 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCP110O43303 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCP110O43303 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCP110O43303 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCP110O43303 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCP110O43303 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCP110O43303 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCP110O43303 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCP110O43303 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCP110O43303 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms