Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr3O09116 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr3O09116 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms