Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ltbp2O08999 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp2O08999 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms