Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckarO08786 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckarO08786 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CckarO08786 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckarO08786 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckarO08786 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckarO08786 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckarO08786 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckarO08786 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CckarO08786 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckarO08786 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckarO08786 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CckarO08786 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CckarO08786 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckarO08786 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CckarO08786 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms