Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM38O00635 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM38O00635 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms