Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3099J3QPA5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3099J3QPA5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms