Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc180J3QNE4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc180J3QNE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc180J3QNE4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms