Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lipo1J3QME6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lipo1J3QME6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lipo1J3QME6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms