Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
2210016F16RikG3X8U3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
2210016F16RikG3X8U3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
2210016F16RikG3X8U3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2210016F16RikG3X8U3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms