Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
BicraF8VPZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BicraF8VPZ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
BicraF8VPZ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
BicraF8VPZ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC39■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
BicraF8VPZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms