Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ercc6F8VPZ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ercc6F8VPZ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ercc6F8VPZ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ercc6F8VPZ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ercc6F8VPZ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms