Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms