Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf212F6TQD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf212F6TQD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms