Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
6030445D17RikE9Q8F9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
6030445D17RikE9Q8F9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms