Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700024B05RikE9Q6D7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700024B05RikE9Q6D7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
1700024B05RikE9Q6D7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms