Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm20425E9Q035 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm20425E9Q035 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms