Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc62E9PVD1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc62E9PVD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms