Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROB1E7EW31 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROB1E7EW31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROB1E7EW31 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms